威尼斯欢乐娱人城精品医学部威尼斯欢乐娱人城精品流行病与卫生统计学系与美国阿拉巴马大学伯明翰分校威尼斯欢乐娱人城精品生物统计系于2015年12月25-29日在威尼斯欢乐娱人城精品独墅湖校区共同举办《精准医学与贝叶斯统计学方法高级培训班》,目前已有来自国内16家知名高校和5家研究机构的55名青年学者注册报名参加。
该培训班聚焦精准医学的热点,结合恶性肿瘤、慢性病临床和生物信息学高维数据介绍构建复杂统计预测、预后模型的相关理论和统计方法,内容包括贝叶斯基本理论、经典的COX模型、处理高维数据的惩罚COX模型、整合临床数据、基因、表观遗传、蛋白组学数据的多水平COX回归模型构建,以及如何运用R等语言及软件包如glmnet、BhGLM等分析国际上流行的肿瘤临床和生物信息学数据库:The Cancer Genome Atlas (TCGA) project。
主讲人简介:易能君博士,是美国阿拉巴玛大学伯明翰分校威尼斯欢乐娱人城精品生物统计系的首席教授(Sir David Cox Endowed Professor),也是威尼斯欢乐娱人城精品讲座教授。近十年的研究工作先后获得两项R01 项目资助,创新性地构建了新的统计遗传模型和分析方法,为复杂疾病的基因发现提供了新的策略。易能君博士在生物统计学、遗传流行病学和贝叶斯统计学研究领域具有重要的影响力。其主要研究成果主要包括:(1)全基因组多基因分析的贝叶斯模型选择。主要论文(Yi et al. 2005)已被广泛引用,并作为同行衡量新方法的参考标准,相关工作得到国际生物统计学界权威专家的髙度评价;(2)针对高维遗传学数据首创了全基因组多个QTL 定位和遗传关联分析Bayesian Lasso 方法,相关成果发表在著名遗传学期刊《Genetics》上(Yi and Xu, 2008);(3)创立了多基因交互作用的贝叶斯广义线性模型(Yi and Banerjee 2009;Yi et al. 2011;Yi and Ma 2013);(4)发展了新的统计方法对二代测序数据进行研究,尤其是国际上比较流行的罕见基因位点的关联研究。相关成果在国际著名期刊(如PNAS, PLOS Genetics, Genetics, Nature Genetics, Bioinformatics)发表。此外,还开发了基于贝叶斯理论的处理高维遗传数据的R 语言程序包BhGLM。
日期 | 地点 | 时间 | 培训内容 | 主讲人 |
12.25 上午 | 401#1412 | 8:30-9:30 | 开幕式+合影 | 芮秀文书记 |
401#1412 | 9:30-11:30 | 精准医学基本统计方法概述 | 易能君教授 | |
12.25 下午 | 401#1412 | 2:00-3:00 | COX模型及R软件的实现 | 易能君教授 |
401#1412 | 3:00-3:20 | 茶歇 | | |
401#1412 | 3:20-4:20 | COX模型及R软件的实现 | 易能君教授 | |
12.26 上午 | 401#1412 | 9:00-10:00 | 基于高维数据的高级COX模型构建(一):惩罚COX模型 | 易能君教授 |
401#1412 | 10:00-10:20 | 茶歇 | | |
401#1412 | 10:20-11:30 | 基于高维数据的高级COX模型构建(一):惩罚COX模型 | 易能君教授 | |
12.26 下午 | 401#1412 | 2:00-3:00 | 基于高维数据的高级COX模型构建(二):贝叶斯多水平COX广义线性模型 | 易能君教授 |
401#1412 | 3:00-3:20 | 茶歇 | | |
401#1412 | 3:20-4:20 | 基于高维数据的高级COX模型构建(二):贝叶斯多水平COX广义线性模型 | 易能君教授 | |
12.27 上午 | 401#1412 | 9:00-10:00 | 预测模型交叉验证 | 易能君教授 |
401#1412 | 10:00-10:20 | 茶歇 | | |
401#1412 | 10:20-11:30 | 预测模型交叉验证 | 易能君教授 | |
12.27 下午 | 401#1412 | 2:00-3:00 | 临床与分子生物学高维数据整合 | 易能君教授 |
401#1412 | 3:00-3:20 | 茶歇 | | |
401#1412 | 3:20-4:20 | 交流会 | 易能君教授 | |
12.28 上午 | 401#1412 | 9:00-10:00 | TCGA数据库应用(一) | 易能君教授 |
401#1412 | 10:00-10:20 | 茶歇 | | |
401#1412 | 10:20-11:30 | TCGA数据库应用(一) | 易能君教授 | |
12.28 下午 | 401#1412 | 2:00-3:00 | TCGA数据库应用(二) | 易能君教授 |
401#1412 | 3:00-3:20 | 茶歇 | | |
401#1412 | 3:20-4:20 | TCGA数据库应用(二) | 易能君教授 | |
12.29 上午 | 706#6106 | 9:00-11:30 | 上机实习(一) | 沈月平等 |
12.29 下午 | 706#6106 | 2:00-4:20 | 上机实习(二) | 沈月平等 |
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